Momsavstämning innebär att företagets bokförda moms kontrolleras innan eller i samband med att momsdeklarationen upprättas. Man jämför framför allt utgående moms på försäljning, ingående moms på inköp och de underlag som ligger till grund för redovisningen. Syftet är att upptäcka fel innan uppgifterna lämnas till Skatteverket.
En avstämning kan exempelvis kontrollera att försäljning med 25 procent moms har gett rimlig utgående moms och att inköpsmomsen motsvarar bokförda leverantörsfakturor och kvitton. Man bör också granska ovanliga poster, omvänd skattskyldighet, EU-handel och andra transaktioner där momsen inte följer ett enkelt standardmönster.
Till sist jämförs momsrapportens saldo med det belopp som ska deklareras och bokföras som momsfordran eller momsskuld. Om bokföringen visar 40 000 kronor i utgående moms och 25 000 kronor i avdragsgill ingående moms blir nettot, förenklat, 15 000 kronor att betala. En momsavstämning gör det lättare att hitta felaktiga momskoder, missade verifikationer och bokningar på fel period.
En dokumenterad momsavstämning är också värdefull om deklarationen senare behöver rättas eller om företaget får frågor om hur ett visst momsbelopp har beräknats.