Ett motkonto är ett konto som används på den andra sidan av en bokföringspost. Eftersom dubbel bokföring kräver att summan i debet är lika stor som summan i kredit måste varje transaktion ha minst två sidor. Det konto som balanserar en viss bokning kan därför beskrivas som dess motkonto.
Om företaget betalar 2 000 kronor i hyra från bankkontot bokförs hyran som kostnad och bankkontot minskar. Bankkontot är då motkonto till hyreskostnaden, och hyreskontot är samtidigt motkonto sett från bankens bokning. Vid mer komplicerade verifikationer kan det finnas flera motkonton, exempelvis när ett inköp delas upp på kostnad, moms och betalning.
Begreppet används ofta när man analyserar huvudboken eller bygger automatiska bokföringsregler. Om en banktransaktion ska kategoriseras behöver systemet veta vilket motkonto som ska användas mot bankkontot. Motkonto är alltså inte en särskild kontotyp i sig. Vilket konto som är motkonto beror på vilken bokföringspost man utgår från och vilken affärshändelse som registreras.