Ett kontrollkonto är ett konto i huvudboken som används för att kontrollera en mer detaljerad sidoordnad redovisning, exempelvis kundreskontra eller leverantörsreskontra. Huvudboken visar totalsaldot medan reskontran visar vilka enskilda kunder eller leverantörer som beloppen hör till.
Kontot för kundfordringar är ett vanligt exempel. Om kundreskontran innehåller tio obetalda fakturor på sammanlagt 85 000 kronor ska kontrollkontot för kundfordringar normalt också visa 85 000 kronor. Om huvudboken visar 82 000 kronor finns en differens som måste undersökas. Den kan bero på en manuell bokning direkt på kontot, en felaktig registrering eller en betalning som bara har bokförts i ett av systemen.
Kontrollkonton gör det möjligt att upptäcka sådana fel utan att behöva granska varje transaktion från början. För att funktionen ska fungera bör man undvika direkta bokningar på kontrollkontot om systemets normala flöde bygger på reskontran. Regelbunden avstämning mellan huvudbok och sidoordnad redovisning är en viktig del av företagets interna kontroll.